Presso il laboratorio vengono caratterizzati acque di scarico, reflui e substrati provenienti o da sottoporre a processi di trattamento. Sono presenti stufa e muffola, distillatore in corrente di vapore con titolatore automatico, torbidimetro, strumenti multiparametrici provvisti di elettrodi ionoselettivi per l’esecuzione di misure in laboratorio e in campo, un sistema per la valutazione del potenziale di bio-metanazione, uno spettrofotometro UV-visibile. Il laboratorio è dotato inoltre di cromatografo ionico, GC-MS, GC con rivelatori TCD e FID e doppio iniettore, spettrometro FTIR.