Il laboratorio è dotato di tutta la strumentazione necessaria a processare un campione biologico dal punto di vista istologico e immnuistochimico. Dispone di un processatore automatico per l'inclusione fino a 300 campioni in paraffina, 2 microtomi per il taglio di sezioni paraffinate, 1 criostato per il taglio di tessuti non paraffinate, due centraline di inclusione, un coloratore automatico di sezioni che garantisce la realizzazione di 24 protocolli di colorazione. La filiera di lavorazione è completata dalla presenza di uno stereomicroscopio e un microscopio ottico, entrambi corredati da telecamera e software per l'osservazione del campione e l'analisi morfometrica.